В результате различных археологических исследований, проведенных до настоящего времени определено, что впервые поселившимися в регионе Ыдыр людьми были Хурри, пришедшие из Центральной Азии (4000 до н.э.). Другие племена, которые пришли с этой общиной под названием Асяник, открыли множество шахт и писаний важных для человечества.
В регионе доминировали арабы-мусульмане в 646 году и сельджуки в 1064 году. Ыгдыр и его окрестности, где после этого периода поселялись многие турецкие племена, также стали домом для племени Кайы, которая была основателем Османской империи.
Ыгдыр получил своё имя в честь Ыгдыр бея, старшего сына Дениза Альфа, младшего сына Огуз-хана.
14 ноября 1920 года он был освобождён от Армянской оккупация армией под командованием Казыма Карабекира и присоеденён к родине.
На основании Закона № 3806, опубликованного в «Официальной газете» от 3 июня 1992 года под номером 21247, он получил статус «Область». В соответствии с тем же законом, Каракоюнлу получил статус района и вместе с районами Аралык и Тузлуджа был присоеденён к области Ыгдыр.